九月中上旬，牡丹生长趋于停止，开始进入休眠期，但根部并未完全停止生长。因此，在10月前后进行牡丹分株最理想。此时根部最容易愈合，能促进新根发出，第2年就能开花。如果分株过晚，根部伤口难愈合，翌年发芽后，新根未生或发生很少，不能满足植株生长和开花时对水分和养分的需求，从而易导致植株萎蔫或死亡；如果分株过早，因气温较高，可能萌发新叶，消耗养分，也会影响第2年的生长和开花。
